Als Dachverband von 18 Islamischen Organisationen ist die BMK bestrebt, primär die Anliegen ihrer Mitgliedsorganisationen zu vertreten. Diese beinhalten vereinsübergreifende Dienstleistungen wie z.B. Bestattungshilfen um die Trägerorganisationen zu entlasten. Selbstverständlich können auch Muslime, die keine Mitglieder in einer muslimischen Vereinigung sind, von den Dienstleistungen der BMK profitieren.
Weiter ist die BMK als Dachverband auch bemüht, gemeinsame Interessen der Mitgliedsorganisationen gegenüber staatlichen Institutionen und umgekehrt zu vermitteln. Aktuell findet das bspw. in der Schulkommission und am Runden Tisch der Religionen statt.
Im Bereich interreligiöser Dialog ist die BMK in der neuen Initiative „Religionen_lokal“ engagiert. In dieser Plattform bietet die BMK islamische Bildungsangebote in deutscher Sprache an.